大晋末年，则是道门最为腐朽堕落的时期之一，此时的道门受到佛门的影响，大谈神通法力，各种胡吹大气，凭空造出好些神仙，偏偏吹牛吹不过佛门，画饼充饥也画不过佛门，太阳真君就是死于这段时期，被大日如来彻底碾压。
此时的道门又摒弃了太上道祖的宇宙之观，理念混乱，道理狗屁不通，经世济民、治国理政方面完败于儒门，哪里还有当年黄老当道的气派，实质上沦为三教垫底。
在此期间，许多道门之人取悦权贵，依附朝廷，走上层路线。其中佼佼者是全真道的神霄祖师通真达灵先生林灵素，他曾与佛门僧人斗法，并对大晋皇帝进言：“释教害道，今虽不可灭，合与改正，将佛刹改为宫观，释迦改为天尊，菩萨改为大士，罗汉改尊者，和尚为德士，皆留发顶冠执简。”
皇帝依奏，下诏改佛为道，易服饰，称姓氏，左右街道录院改作道德院，僧录司改作德士司，隶属道德院。不久又改尼姑为女德。
皇太子上殿争之，令胡僧立藏等十二人和五台僧二人、道坚等与林灵素斗法，结果僧人大败，情愿戴冠执简。
今日的“佛门大德”便是由此而来。
不过这位全真道祖师的下场并不好，京城洪水期间，佛道二次斗法，有蛟螭出现，林灵素以左道用事，杀死蛟螭，洪水却不曾退去，人们都以为是亡国之象。因僧伽大士显灵，洪水方才退去。林灵素因此离开京城，返回故乡，不久后便神秘陨落。
在后世的评价中，无论是道门自己，还是儒门佛门，都对这位祖师持否定态度。
再后来，就是金帐南下，大晋国灭。全真道的另外一位祖师开始崭露头角。
全真道五祖之中，重阳祖师是最后一位祖师，他有七位弟子，陆续出任全真道掌教一职，丹阳真人之后由长生真人接任，长生真人之后由长春真人接任，这位长春真人曾经在垂暮之年远赴塞外，出铁门关，抵达大雪山行宫，面见金帐汗王，劝谏金帐汗王“敬天爱民、减少屠杀、清心寡欲”，被金帐汗王尊奉为“神仙”。
长春真人返回当时还叫燕京的帝京之后，金帐汗王赐下虎符、玺书，命他总领天下道门，并下诏免除道院、道士一切赋税差役，于是全真道再次兴盛，在帝京大量建立宫观，设坛作醮，一时教门四辟，道侣云集。