崇祯十二年几乎是刘锡命体系下制度建设的元年。
在回到京师之后，刘锡命会同黄宗会、杜良骥等人夜商议，制定下了许多制度，这才能在崇祯十二年五月由吕宋将军府颁布出来。
为了进一步规范官员制度，刘锡命在参考了多方意见之后，对于教育制度也进行了大幅改革。
自此以后，所有想要进入将军府体系任职的人员都必须通过科举考试才能获取资格。
当然，此科举非彼科举。
在刘锡命的制度中，由将军府统一设立乡学、县学和府学三级学校，分别对应小学、初中和高中。
参加完九年乡学和县学教育并通过考试的人称之为童生，三年府学考完称之为秀才。
府学之后必须进入太学就读五年，若是毕业，则被称为举人。
举人之后，若是想要从政，便可以报考国子监，学习毕业后获得进士学位，直接授官任职。
当然，举人也可以不考进士，直接报考官吏选拔考试。
区别在于，进士授官直接授予正八位吏员，工作一段时间后可以转任从九品政务官或者事务官。